Com a mètode de treball, Aula Barcelona, vol compatibilitzar una anàlisi realista que tingui en compte el punt de vista dels responsables de la gestió i a la vegada un enfocament, més teòric, dels acadèmics.

Es vol adoptar també un mètode multidisciplinari per tal de considerar la realitat en tota la seva complexitat, i en aquest sentit vol treballar en règim de comissions a fi de permetre la presència de posicions i punts de vista diversos a l'hora d'abordar els temes a estudiar.

A partir dels professionals i institucions que integren la Xarxa Aula Barcelona s'organitzen cinc comissions:

• Governabilitat i el Nou Model institucional
• El Nou Model econòmic/tecnològic
• Cohesió social i el Nou Model urbà
• El Nou Model territorial
• Estratègies de projecció i el Nou Model exterior